在认证方式上来说，QS9000强调第三方的认证。认证的流程与ISO9000认证一致，只是在认可和认证的要求上增加的特殊要求，如：
1) 第三方认证评审必须采用QSA作为审核输入。尽管QSA只是一个固定的提问清单并不见得会被评审员直接用来提问，但这样的提问清单可减少不同认证机构之间的差别。
2) 已获ISO9000注册并不能免除还应满足QS9000的要求，即对于需采用QS9000的组织只获得ISO9000注册是不充分的。
3) 认证机构必须被顾客认可的国家机构认可。目前已有多家的认可机构被顾客接受。（如中国的CNACR和CNAB）
4) 对所有的向三大汽车公司提供产品和服务供应方来说，QS9000是合同要求。
5) 整个质量体系评定至少每三年进行一次，而对每一次评审不允许采用滚动式评审的方式。可采用"合格/一般/严重"不符合状态或者是每个要素从0到10分的计分.
6) 在评审中如未发现任何不符合项时，将给出"通过"结论。
7) 当存在一个严重或有一般不符合项时，将给出"待定（OPEN）"结论。当在60天内收到符合证据并认可后，结论可转为"通过"。当存在多于一个严重不符合项时，或在60天内未对不合格项进行整改，将给出"不通过"结论。
8) 所有的现场和外部场所(如采购、设计)必须在一张证书中覆盖。
9) 每个场所至少在每12个月接受一次监督审核。
10) 在取得QS9000证书后，获证企业将被登录到三大汽车公司授权的美国质量协会ASQ的专门网站上，需要获得相关信息的公司可以从其网站上查找相关的内容。
